L’aspetto innovativo del CeRICT risiede non solo negli obiettivi, ma anche nella sua peculiare struttura organizzativa per competenze integrate che prevede:

• una profonda partnership tra i soggetti coinvolti, basata sulla condivisione degli obiettivi, delle risorse e dei rischi;
• una reale integrazione delle competenze nella realizzazione di progetti congiunti tra i diversi soggetti coinvolti;
• il consolidamento di una visione progettuale, la costante creatività e l’innovazione continua.

La struttura del CeRICT ottimizza i vantaggi derivanti dalla specializzazione del modello divisionale, cui si riferisce la parte superiore dell’organigramma, a quelli derivanti dalla strutturata area delle competenze tecnologiche.
Tale peculiare struttura organizzativa del CeRICT SCaRL consente di attivare in maniera diretta o indiretta conoscenze scientifiche specialistiche non solo nel settore ICT ma anche, in maniera trasversale, in altri settori ad esso già connessi o potenzialmente collegabili.

MANAGING DIRECTOR - Funzione generale di riferimento delle attività del CeRICT. Ha l’obiettivo di perseguire e raggiungere gli obiettivi strategici definiti dagli Organi di governo della Società. A tale scopo, gestisce tutte le fasi che vanno dalla individuazione delle idee progettuali alla loro definizione, contrattualizzazione e realizzazione, fino alla chiusura finale dei progetti. Controlla gli aspetti economico-finanziari, le implicazioni legali sia interne che nei confronti dei partners/clienti, cura le relazioni di alto livello della società, è punto di riferimento nella gestione del personale interno ed esterno.
OFFICE ADMINISTRATION - Funzione di supporto ed assistenza all’attività del CeRICT. Gestisce i flussi documentali, il protocollo, e gli archivi. Funge da segreteria degli Organi di governo e del il Direttore Generale; in questa veste, in particolare orgnanizza le riunioni e la partecipazione a convegni ed eventi. Si occupa degli adempimenti connessi alla(e) sede(i) del CeRICT. Cura gli adempimenti bancari e gestisce i rapporti con i fornitori di servizi. Effettua gli ordini ai fornitori dei materiali e delle apparecchiature necessarie alla gestione corrente della società.  
FINANCE AND ADMINISTRATION  OFFICE – Funzione che ha l’obiettivo di gestire le risorse economiche della società. Cura, secondo le indicazioni del Managing Director, la definizione del budget aziendale e assicura che le attività della società si svolgano nel rispetto di tale budget. Controlla, pertanto, costi e ricavi legati alla gestione ed alla produzione, segnalando al Managing Director situazioni che necessitano attenzione e concordando eventuali azioni a riguardo. Gestisce la funzione esterna di Accounting.
ACCOUNTING - Unità esterna di tipo consulenziale cui competono tutte le attività relative all’area di registrazione economico-finanziaria. Le principali attività di quest’area sono relative alla contabilità generale ed analitica, alla redazione di bilanci, fatturazione, all’espletamento di obblighi ed adempimenti di tipo civilistico, fiscale e societario. Fornisce alla funzione di Finance and Administration tutte le evidenze contabili per valutare efficacia, efficienza ed economicità dell’attività societaria.
LEGAL OFFICE – Funzione che ha l’obiettivo di garntire l’azienda rispetto agli aspetti legali e giuridici sia interni che esterni. In particolare, dal punto di vista interno cura la contrattualistica con i consulenti e prestatori d’opera e con il personale da assumere. Dal punto di vista esterno, verifica gli aspetti legali dei bandi pubblici cui la società intende concorrere e partecipa alla definizione degli aspetti legali dei contratti che la società intende stipulare con soggetti privati, partecipa alla stesura degli statuti di consorzi/società cui la società intende partecipare. Cura infine i rapporti con consulenti legali esterni.
QUALITY – Funzione che si occupa del controllo, della supervisione e dello sviluppo del Sistema di Gestione per la Qualità. Verifica, attraverso incontri periodici, che le attività della società siano realizzate secondo quanto previsto nei manuali del Sistema. Su indicazione del Managing Director, apporta cambiamenti ai manuali, anche sulla scorta dei rilievi effettuati nel corso delle verifiche e trasmessi al Managing Director.
TECHNICALl SCIENTIFIC COMMITTEE – Organo composto da membri indicati dai soci a copertura delle competenze tecnico-scientifiche presenti nella società. Ha funzione strategica e di indirizzo scientifico per i progetti posti in essere e predispone il piano annuale di attività. Affianca il Direttore Generale nella definizione dei progetti di ricerca, formula proposte regolamentari per il buon funzionamento degli organismi interni e in ordine ad eventuali rapporti di collaborazione esterni.
RELATIONSCHIP OFFICE – Funzione cha ha l’obiettivo di coordinare le interazioni tra le Funzioni Aziendali nella definizione e gestione dei Progetti (attività interna) e di gestire, secondo le indicazioni del Managing Director, i rapporti con le imprese, con i clienti e le relazioni istituzionali esterne (attività esterna). Nell’ambito delle attività esterne, provvede all’organizzazione di convegni, seminari e alla partecipazione del CeRICT ad eventi istituzionali, promuove e diffonde le iniziative del CeRICT, gestisce i rapporti con il mondo accademico e con le istituzioni di riferimento. Opera in diretto collegamento con il CeRICT Liaison, per attività di diffusione e coinvolgimento delle imprese.
CeRICT LIAISON – Unità organizzativa esterna che ha l’obiettivo di diffondere i risultati dei progetti realizzati dal CeRICT e di coinvolgere in programmi e progetti di innovazione gli attori del sistema in cui il CeRICT opera.  Interagisce con gli enti territoriali e, coerentemente con la strategia del CeRICT, opera nell’intento di stabilire relazioni con le aziende operanti sul territorio.
PROGRAM OFFICE - Funzione che ha l’obiettivo di monitorare e controllare le diverse fasi progettuali attraverso un sistema di misurazione che identifica e prevede i rischi del Progetto, attraverso l’analisi di scostamento degli stati di avanzamento.  Il Program Office si occupa, in particolare, degli aspetti legati alla tempistica, agli effort  e al rispetto dei requisiti di Progetto. Il Program Office, infine, individua gli strumenti per l’identificazione di eventuali “alert” in fase di esecuzione, determinando i relativi correttivi da apportare al verificarsi degli scostamenti prefissati.
GRUPPO INFRASTURTTURA TECNOLOGICA – Unità organizzativa esterna di tipo consulenziale cui competono tutte le attività di progettazione e/o adeguamento dell’infrastruttura tecnologica, necessarie a soddisfare gli obiettivi definiti dal Progetto.  Il Gruppo Infrastruttura Tecnologica opera su indicazioni del Program Office con cui è in diretto collegamento.
HUMAN RESOURCES MANAGEMENT OFFICE – Funzione che si occupa sia della gestione dello stato giuridico-amministrativo del personale, sia delle relative competenze tecnologiche. Monitora le competenze presenti nello staff di produzione e la loro evoluzione, effettua un constante controllo delle capacità delle risorse disponibili e propone loro allocazione sui progetti in corso. Si occupa delle procedure concorsuali interne ed esterne.
AREA DELLE COMPETENZE TECNOLOGICHE – Costituisce una struttura altamente flessibile, composta da oltre 220 esperti tra Professori, Ricercatori e Tecnici, appartenenti ai Partner Interni del CeRICT, capace di adattarsi alle varie esigenze progettuali. Rappresenta il set di core-competence del CeRICT ed opera a contatto diretto con il Managing Director. E’ divisa in due comparti di specializzazione, uno che raggruppa le competenze del settore informatico (IT) e l’ altro del settore delle telecomunicazioni (TLC).  Le aree di concentrazione di competenze assimilabili, divise in Poli, rappresentano un’aggregazione virtuale e non fisica delle competenze dei ricercatori operanti nelle diverse strutture di ricerca.